02- Lungs - Meer onderzoek naar HU waarden

Een prof (Dr. Bram van Ginneken, Professor of Functional Image Analysis at Radboud University Medical Center, ) Heeeee Nederland!!!!neemt ons mee door een aantal ct-scans om aan te geven wat er feitelijk gezocht moet worden.  Daarin worden als je goed kijkt zowel de laag als de HU- waarde van de scan weergegeven. Het vraagt wat handigheid om de video op de goede tijd te stoppen maar dan lijkt er een beeld te ontstaan welke HU waarde de kankercellen en andere indicatieve kenmerken hebben.

Hier een stukje uit het in de video behandelde onderzoek met de relevante 'predictors':

Helaas zijn er geen zaken als sex, familie geschiedenis en leeftijd in de data beschikbaar. Wel emphysema / nodule size / location of nodule / part-solid (HU waarde?) / Lower nodule count / spiculation. Althans daar ga ik vanuit dat dit uit de afbeeldingen en de HU waardes is af te leiden.
Ik leg voorlopig ongeveer deze waarden vast:

# calcium > 1000

# cancer : -300 <-> -50

# emphysima -1005<-> -800 

Het eerste idee is dat ik deze reeksen wellicht kan benadrukken door er een juiste 'gauss-kromme' op los te laten.  

De schaal krijg ik even niet gelijk aan de HU-schaal dus ik heb er 2000 bij op geteld. De piek rond 1000 is dus de emphysima, De brede piek zijn de kankercellen en de piek bij 3000 is calcium. De rest van de HU waarden zijn dan vermoedelijk onnodig en kunnen naar nul worden teruggebracht. Daarmee wordt de beschikbare data wellicht een heel stuk teruggebracht. De breedte van curves moet ik ook nog wat mee experimenteren.