donderdag 31 december 2015

MRI - 08 - Onderzoek SliceLocation

Na een kleine worsteling om de juiste sortering terug te krijgen uit een list met alle studies, sax-lagen en bestandsnamen (Op zich eenvoudig - numeriek sorteren op 2 kolommen) lukt het om inzicht te krijgen in achtereenvolgende SliceLocations. En dat blijkt zeer noodzakelijk! De meestgebruikte afstand is 10 mm. Soms, om onduidelijke reden, afgewisseld met 8 mm. De leeftijd lijkt daar in ieder geval niet altijd een indicator voor. De positie hoogt soms op en soms neer. De 'hartrichting' lijkt gelukkig in dezelfde richting. Dat wil zeggen dat er steeds van het brede gedeelte naar 'de punt' lijkt te worden gescand. (Ik weet nog niet of dat relevant gaat zijn) Zie hier een voorbeeld stukje van de output: (kolommen: study, sax slice, file, location, distance, age)

51 sax_14 /Users/DWW/data/train/51/study/sax_14/IM-3536-0001.dcm 95.953565415562 10.0 055Y
51 sax_15 /Users/DWW/data/train/51/study/sax_15/IM-3537-0001.dcm 105.95356694642 10.0 055Y
51 sax_16 /Users/DWW/data/train/51/study/sax_16/IM-3538-0001.dcm 115.95356847727 10.0 055Y
51 sax_17 /Users/DWW/data/train/51/study/sax_17/IM-3539-0001.dcm 125.95356469696 10.0 055Y
51 sax_19 /Users/DWW/data/train/51/study/sax_19/IM-3540-0001.dcm 135.95362064292 10.0 055Y
52 sax_12 /Users/DWW/data/train/52/study/sax_12/IM-0128-0001.dcm 4.5424673200997 0.0 014Y
52 sax_13 /Users/DWW/data/train/52/study/sax_13/IM-0129-0001.dcm -5.4575311672849 -10.0 014Y
52 sax_14 /Users/DWW/data/train/52/study/sax_14/IM-0130-0001.dcm -15.457530568612 -10.0 014Y
52 sax_15 /Users/DWW/data/train/52/study/sax_15/IM-0131-0001.dcm -25.457532441208 -10.0 014Y
52 sax_16 /Users/DWW/data/train/52/study/sax_16/IM-0132-0001.dcm -35.45753052627 -10.0 014Y

52 sax_17 /Users/DWW/data/train/52/study/sax_17/IM-0133-0001.dcm -45.457531243862 -10.0 014Y

De meeste lijken verder consistent maar er zitten ook dit soort bij:

49 sax_5 /Users/DWW/data/train/49/study/sax_5/IM-6818-0001.dcm -37.262080772284 0.0 040Y
49 sax_6 /Users/DWW/data/train/49/study/sax_6/IM-6819-0001.dcm -47.262081561521 -10.0 040Y
49 sax_7 /Users/DWW/data/train/49/study/sax_7/IM-6820-0001.dcm -57.262082906974 -10.0 040Y
49 sax_8 /Users/DWW/data/train/49/study/sax_8/IM-6821-0001.dcm -67.262083002317 -10.0 040Y
49 sax_9 /Users/DWW/data/train/49/study/sax_9/IM-6822-0001.dcm -77.262088061653 -10.0 040Y
49 sax_10 /Users/DWW/data/train/49/study/sax_10/IM-6823-0001.dcm -87.262089407106 -10.0 040Y
49 sax_11 /Users/DWW/data/train/49/study/sax_11/IM-6824-0001.dcm -97.262090752559 -10.0 040Y
49 sax_12 /Users/DWW/data/train/49/study/sax_12/IM-6825-0001.dcm -87.262089407106 10.0 040Y
49 sax_13 /Users/DWW/data/train/49/study/sax_13/IM-6826-0001.dcm -107.26209099658 -20.0 040Y
49 sax_14 /Users/DWW/data/train/49/study/sax_14/IM-6827-0001.dcm -117.26209094324 -10.0 040Y
49 sax_15 /Users/DWW/data/train/49/study/sax_15/IM-6828-0001.dcm -127.26209368749 -10.0 040Y
49 sax_16 /Users/DWW/data/train/49/study/sax_16/IM-6829-0001.dcm -137.26209363415 -10.0 040Y

49 sax_20 /Users/DWW/data/train/49/study/sax_20/IM-6832-0001.dcm -97.261893063264 40.0 040Y

Hier doet slice sax_12 nog eens sax_10 over om daarna weer 'netjes' verder te gaan tot op het eind waar sax_20 nog even sax_11 ook herhaald! In het bij de wedstrijd behorende blog wordt aangegeven dat dit vaak te maken heeft met 'scan-issues' (beeldverstoringen) en dat er dan vanuit gegaan mag worden dat de 2e scan de beste is. Dat verklaart dus misschien ook (deels) de variatie in lagen. Onderdeel van de voorbereiding zal dus zijn het laten vervallen van de eerste van 'dubbele slices'.

De totale afstand tussen de eerste en de laatste slice varieert van zo'n 64 tot 120 mm. Dat lijkt maar deels met de leeftijd te maken te hebben. Nooit gedacht dat er zoveel verschil kan zijn.



  




Geen opmerkingen:

Een reactie posten